هگزان در صنایع مختلفی کاربرد دارد. این ترکیب شیمیایی مانند بنزین، بسیار فرار است و خطر انفجار دارد. Hexane در تولید پوشاک، کالاهای چرمی و انواع چسب استفاده می‌شود. همچنین برای استخراج روغن پخت‌وپز از دانه‌هایی مانند کانولا یا سویا و در چربی‌زدایی انواع محصولات و در صنعت نساجی نیز استفاده می‌شود. همچنین به دلیل خاصیت چربی‌زدایی که دارد در فرمولاسیون برخی از پاک‌کننده‌ها نیز استفاده می‌شود.

هگزان یکی از حلال‌های آلی به شمار می‌رود. اما همان‌طور که قبلاً هم اشاره شد هگزان یک حلال کاملاً غیرقطبی است در نتیجه اگر بخواهید یک ترکیب غیرقطبی را حل کنید، این ماده یک حلال قوی است. اما، اگر می‌خواهید از Hexane برای حل کردن یک ترکیب قطبی استفاده کنید، موفق نخواهید شد.

برای ترکیبات قطبی، آب گزینه بهتری نسبت به Hexane خواهد بود، زیرا آب قطبی است و می‌تواند راحت‌تر با ترکیبات قطبی برهم‌کنش کند. اگر هگزان را به آب اضافه کنیم، Hexane بدون اختلاط ظاهری در بالای آب شناور می‌ماند. ازآنجایی‌که حلال هگزان را نمی‌توان به‌راحتی پروتون‌زدایی کرد، می‌توان از آن در آزمایشگاه برای واکنش‌هایی که شامل بازهای قوی‌تر هستند، استفاده کرد.

• یکی از رایج‌ترین حلال‌های مورداستفاده در واکنش‌های مصنوعی با استفاده از لیپازها به شمار می‌رود.
• در تولید بیودیزل استفاده می‌شود.
• Hexane در گریدهای تجاری به‌عنوان حلال برای لاک، جوهر و چسب استفاده می‌شود.
• از دهه 1940 به‌عنوان حلال برای استخراج روغن دانه‌های گیاهی و سایر روغن‌های غیرنفتی استفاده می‌شود.
• در محصولات چرمی و فرمولاسیون چسب کفش کاربرد دارد.
• Hexane در استخراج آلاینده‌های روغن و گریس از خاک و آب استفاده می‌شود.
• در کروماتوگرافی به‌عنوان یک حلال غیرقطبی کاربرد دارد.